Eestis tarbitakse peaaegu ainult kodumaiseid pagaritooteid. Pagaritööstuse kujunemisel on olnud oluline koht rukkileival. Praeguseks on pagaritööstusettevõtted erastatud ning tekkinud on arvukalt uusi, peamiselt väikeettevõtteid.

Eestlaste toitumisharjumuste kohaselt tarbitakse rukki- ja nisutooteid enam-vähem võrdselt, kuid viimastel aastatel on rukkileiva osatähtsus siiski vähenenud. Põhitoodanguks on värsked pagari- ja kondiitritooted. Alates 1992. aastast on rakendatud uusimat tehnoloogiat, sh jahuparandajaid, pooltooteid, konteinerahjusid, tainatöötlemisseadmeid jm, mis on võimaldanud tõsta toodete kvaliteedi konkurentsivõimelisele tasemele.